Procuradoria Geral do Estado
Fundo de  Manutenção e Reaparelhamento da Procuradoria Geral

Secretaria da Fazenda
Fundo de Modernização da Administração Fazendária
Fundo de Proteção Social do Estado de Goiás – PROTEGE GOIÁS
Fundo de Aporte à CELGPAR

Secretaria da Saúde
Fundo Especial de Gestão da Escola Estadual de Saúde Pública de Goiás Cândido Santiago – FUNGESP
Fundo Especial de Saúde

Secretaria da Segurança Pública
Fundo Penitenciário Estadual – FUNPES
Fundo Estadual de Proteção e Defesa do Consumidor

Secretaria das Cidades
Fundo Estadual de Habitação de Interesse Social – FEHIS

Secretaria de Agricultura, Pecuária e Abastecimento
Fundo Especial de Desenvolvimento Rural

Secretaria de Cidadania e Trabalho
Fundo Estadual de Assistência Social
Fundo Estadual dos Direitos da Criança e do Adolescente – FECAD

Secretaria de Ciência e Tecnologia
Fundo de Capacitação e Profissionalização do Estado de Goiás – FUNCAPE
Fundo Estadual de Ciência e Tecnologia

Secretaria de Indústria e Comércio
Fundo de Participação e Fomento à Industrialização –FOMENTAR
Fundo de Desenvolvimento de Atividades Industriais – FUNPRODUZIR
Fundo de Fomento a Mineração

Secretaria do Meio Ambiente e dos Recursos Hídricos
Fundo Estadual do Meio Ambiente

Secretaria do Planejamento e Desenvolvimento
Fundo de Fomento ao Desenvolvimento Econômico e Social de Goiás – FUNDES