Inaugurada em 9 de novembro de 1922, marcou o surgimento da cidade de Pires do Rio. Seu nome é uma homenagem a José Pires do Rio, Ministro da Viação e Obras Públicas da época e que esteve na região para inspecionar a construção da ponte ferroviária Epitácio Pessoa sobre o rio Corumbá.

Construída como parte da expansão da Estrada de Ferro Goyaz, a estação se tornou ponto estratégico para o escoamento de produtos, e foi o coração da nova cidade, sendo cenário de encontros, despedidas, progresso e trabalho. Por seus trilhos passaram milhares de pessoas, mercadorias, e também os materiais que ajudaram a construir Goiânia e Brasília.

Mesmo com o fim da operação ferroviária para passageiros na cidade, a Estação de Pires do Rio permanece como um importante patrimônio histórico e cultural de Goiás.