As dez balsas administradas pela Agetop, que fazem a travessia de veículos sob alguns rios do estado, recebem serviços de conservação. Estão sendo realizados reparos nos alambrados, guinchos de elevação das plataformas, pintura na casa de abrigo das balsas, fixação de placas de identificação, entre outros. As balsas atuam de acordo com as exigências da Capitania Fluvial de Brasília (Marinha do Brasil), sendo que algumas são motorizadas com propulsão própria e outras movidas a cabo de aço.

Balsas que são gerenciadas pela Agetop atravessam os seguintes rios com seus respectivos nomes: Rio Caiapó (Ada, GO-188), Rio Maranhão (Darlene, GO-080 Barro Alto/Niquelândia), Rio Paranaíba (Helena, GO-210 / Davinópolis – divisa GO/MG), Lago dos Tigres (Judite, GO-324 / Britânia), Rio das Almas (Júlia, GO-338 / São Luiz do Norte), Rio São Marcos (Soledade, GO-213 / Campo Alegre de Goiás), Rio São Felix (Cana Brava, GO-464 / Cavalcante-Minaçu), Rio Paranaíba (Líbia, GO-330 / Três Ranchos – divisa GO/MG), Rio Crixás-Açu (Sandra, GO-239 / Amaralina-Novo Mundo) e Rio Paranã (Viviane, GO-112 / Nova Roma- Campos Belos).